PCR 引物
Random Amplified Polymorphic DNA Primers
RAPD 引物
RAPD 技術是以 10 mer 的隨機寡核甘酸片段作為引物，對基因組進行 PCR 擴增，擴增產物通過瓊脂糖凝膠電泳或 PAGE 電泳檢測，研究 DNA 的多態性，即反應了基因組相應片段由於堿基發生缺失、插入、突變、重排等所引發的 DNA 多態性。
| 純化方式 | 堿基長度 | 交付形式 | 包裝形式 | 額外QC | 合成周期 |
|---|---|---|---|---|---|
| HPLC | 10 mer | 液體/幹粉 | 管裝 | - | ≤5 工作日 |
Endogenous Reference Genes Primers
內參引物
在研究不同細胞類型，發育階段，和/或樣品處理時，內源性參照基因的選擇就至關重要，內參基因通常是各種看家基因，在細胞內組成穩定性表達，有助於保持細胞的功能。生工根據 GenBank 上公布的序列，通過 BLAST 搜索和實驗驗證，推出了高特異性的內源性參照基因的引物。
備注：具體詳見生工官網，直接搜索 “內參引物” 即可。
測序引物
Universal Primers
通用引物
通用引物是一般和載體多克隆位點兩旁的序列匹配，或是與載體裏麵的一些啟動、終止元件匹配，目的是擴出 DNA 片段，主要用來進行測序。
Universal Primers For Strain Identification
菌種鑒定通用引物（常用）
通過 DNA 測序對微生物進行物種鑒定（菌種鑒定）是比傳統生化鑒定更先進的鑒定方法。DNA 測序不依賴菌種本身特點，對所有菌種均可使用，包括細菌 16s rDNA 鑒定和真菌 26s rDNA 鑒定、真菌 ITS 和真菌 18s 鑒定。
| 所屬類別 | 名稱 | 序列 5‘-3’ | 擴增序列 | PCR 長度/bp |
|---|---|---|---|---|
| 細菌 | 7F 1540R | CAGAGTTTGATCCTGGCT AGGAGGTGATCCAGCCGCA |
16S rDNA | 1500 bp 左右 |
| 27F 1492R | AGAGTTTGATCCTGGCTCAG TACGGCTACCTTGTTACGACTT |
16S rDNA | 1500 bp 左右 | |
| 真菌 | ITS1 ITS4 | TCCGTAGGTGAACCTGCGG TCCTCCGCTTATTGATATGC |
內轉錄間隔 區 1 和 2 |
600 bp 左右 |
| NS1 NS6 | GTAGTCATATGCTTGTCTC GCATCACAGACCTGTTATTGCCTC |
18S rDNA | 1300 bp 左右 | |
| 酵母菌 | NL1 NL4 | GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG GGTCCGTGTTTCAAGACGG |
26S rDNA D1/D2 區 |
500 bp 左右 |
NGS 引物探針
文庫構建相關引物
SanNGS UDI Adapters for IIIumina
SanNGS UDI 接頭引物（適用於 IIIumina）
本試劑盒是適配 IIIumina 高通量測序平台文庫構建的接頭試劑盒，包含兩種組分，其中 Adapter 用於末端修複 tail A 之後DNA 或者 cDNA 的連接反應；index 引物用於後續擴增文庫，文庫經過長度分選之後，即可上機測序。該本試劑盒 index 采用主流的 8 堿基雙端唯一（也稱 UDI）接頭，可以有效防止 IIIumina 平台標簽跳躍（index hopping）現象導致的數據交叉汙染。本試劑盒可滿足多樣品 IIIumina 文庫構建，試劑盒內的組分經過嚴格質控，盡可能地降低了交叉汙染比例，可以最大限度盡力保證文庫構建過程的穩定性及可靠性。
特點：
Adapter 序列更短些，結構更穩定；
DNA 連接產物可以通過少數幾個 PCR 循環，快速獲得新 index 組合文庫。當文庫出現 index 重複的時候，隻需要將其中一個文庫的連接產物更換 index 引物重新擴增 8～10 個循環即可快速獲得新的 index 文庫，幾乎不耽誤測序進度。
| 產品編號 | 品牌 | 組分 |
|---|---|---|
| SanNGS UDI 接頭引物用於 IIIumina 平台，index 1～12（48 Rxn/192 Rxn） | ||
| H591001 | 生工 | index 1～12 10 μl each + short Adapter, 120 μl |
| index 1～12 40 μl each + short Adapter, 120 μl x 4 | ||
| SanNGS UDI 接頭引物用於 IIIumina 平台，index 1～24（96 Rxn/384 Rxn） | ||
| H591002 | 生工 | index 1～24 10 μl each + short Adapter, 120 μl |
| index 1～24 40 μl each + short Adapter, 120 μl x 4 | ||
| SanNGS UDI 接頭引物用於 IIIumina 平台，index 1～96（384 Rxn/1536 Rxn） | ||
| H591003 | 生工 | index 1～96 10 μl each + short Adapter, 120 μl |
| index 1～96 40 μl each + short Adapter, 120 μl x 4 | ||
靶向捕獲相關引物
SanNGS Universal Blocker for IIIumina TruSeq Library
SanNGS 通用 Blocker 引物（適用於 IIIumina TruSeq 文庫）
SanNGS 通用 Blocker 引物（適用於 IIIumina TruSeq 文庫）在進行液相探針雜交捕獲時使用，可有效阻斷 Adapter 之間相互結合，提高探針捕獲的特異性和中靶率。如果不添加 Blocker 引物，液相 DNA 雜交捕獲過程中，極有可能形成雜交結構。Blocker 的主要作用就是阻止上述結構的形成，從而提高捕獲中靶率。
特點：
阻封效能高，價格低；
不需要一對一的添加，可以一對多使用，主要是阻封 IIIumina TruSeq 係列雙端 8 堿基接頭；
可接受定製。
| 產品編號 | 品牌 | 組分 |
|---|---|---|
| 通用 Blocker 引物（適用於 IIIumina TruSeq 文庫） | ||
| H592001 | 生工 | 8/16/96 Rnx |
全基因組擴增引物
Multiple Displacement Amplification Primers
MDA 引物
MDA 技術即多重置換擴增技術，需要使用多種引物六聚體和 φ29DNA 聚合酶。引物六聚體先隨機結合到 DNA 模版上，在φ29DNA 聚合酶調解下延伸，當遇到另一條新鏈隨機引物時，φ29DNA 聚合酶替換引物，繼續延伸，形成支鏈結構，新的引物和聚合酶會在支鏈上重新結合延伸，所形成的 DNA 片段一般為 50～100 kb。引物六聚體是由 6 個隨機核苷酸組成的，用於擴增全基因組。
| 純化方式 | 堿基長度 | 交付形式 | 包裝形式 | 額外 QC | 合成周期 |
|---|---|---|---|---|---|
| HPLC | 6 mer | 液體/幹粉 | 管裝 | - | ≤5 工作日 |
Degenerate Oligonucleotide Primed PCR Primers
DOP PCR 引物
DOP PCR 技術即退化寡核苷酸引物 PCR, 是隨機擴增得到全基因組序列的。該技術需要使用簡並配對引物，即類脫氧肌苷引物，它可以結合到 DNA 任何部位。引物的 3' 端為 6 bp 退化寡核苷酸，5' 端為正常的堿基，引物中間部門含有 6 個隨機堿基。3' 端和 DNA 鏈隨機結合，最初幾個循環退火溫度要低（30°C 左右），然後延伸直到 5' 端引物配對處。
| 純化方式 | 堿基長度 | 交付形式 | 包裝形式 | 額外 QC | 合成周期 |
|---|---|---|---|---|---|
| HPLC/ULTRAPAGE | 20~35 mer | 液體/幹粉 | 管裝 | - | ≤5 工作日 |
Multiple Annealing and Looping-Based Amplification Cycles Primers
MALBAC 引物
MALBAC 技術即多次退火環狀循環擴增技術，MALBAC 所用引物 5' 端為固定的 27 個堿基通用序列，3' 端 8 個隨機堿基序列。
| 純化方式 | 堿基長度 | 交付形式 | 包裝形式 | 額外 QC | 合成周期 |
|---|---|---|---|---|---|
| HPLC | 35 mer | 液體/幹粉 | 管裝 | - | ≤5 工作日 |
Primerextension Preamplification Primers
PEP 引物
PEP 技術即引物延伸預擴增法技術，使用 15 個堿基長的隨機引物（N15）, 在 37°C 的低退火溫度下進行較長時間的退火，然後緩慢升溫至 55°C 進行長時間的引物延伸，如此反複多個循環。
| 純化方式 | 堿基長度 | 交付形式 | 包裝形式 | 額外 QC | 合成周期 |
|---|---|---|---|---|---|
| HPLC | 15 mer | 液體/幹粉 | 管裝 | - | ≤5 工作日 |