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真核/原核有參mRNA-Seq
項目介紹

轉錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的集合,狹義上指所有mRNA的集合。轉錄組是研究基因表達的主要手段,是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質組的紐帶。轉錄水平的調控是生物體重要的調控方式,通過轉錄組測序分析轉錄水平的調控,是目前運用較多的研究方式。

技術支持

電 話:021-57072097
021-57072177

E-mail: rnaseq@sangon.com
rnaseq2@sangon.com

測序使用Illumina Xten平台,測序原始數據經過質控後,mapping至參考基因組序列,對mapping到基因上的reads進行計數,計算基因的表達量後,進行基因表達差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對於多個樣本,可進行重複相關性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外,依據參考基因組,可進行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗證性分析;可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉錄本預測以及聯合miRNA數據進行關聯分析等分析。另外,還可以進行基因功能互作、蛋白網絡互作等分析,深入研究基因功能,進一步揭示基因間互作網絡等信息,為研究網絡調控機理提供方向。

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組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,幹冰運輸。 具體要求參看官網高通量測序介紹頁麵中的《RNA類高通量測序樣品要求》。

提供信息

告知物種信息以及對照與實驗樣品(如有分組,詳細描述分組分析信息)

交付
  1. 測序原始數據
  2. 實驗結果類文件
  3. 分析報告以及分析結果文件
  4. 部分發表文章用的方法描述
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